Field Detail

• modelCount

  private int modelCount

• ac

  private int ac

• bondData

  private java.lang.String bondData

• moCount

  private int moCount

• coefCount

  private int coefCount

• shellCount

  private int shellCount

• gaussianCount

  private int gaussianCount

• endCheck

  private java.lang.String endCheck

• isSMOL

  private boolean isSMOL

• r

  private BasisFunctionReader r

• modelAtomCount

  private int modelAtomCount

• line

  private java.lang.String line

Constructor Detail

• SpartanArchive

  SpartanArchive​(BasisFunctionReader r,
                 java.lang.String bondData,
                 java.lang.String endCheck)

Method Detail

• initialize

  private void initialize​(BasisFunctionReader r,
                          java.lang.String bondData)

• readArchive

  int readArchive​(java.lang.String infoLine,
                  boolean haveGeometryLine,
                  int ac0,
                  boolean doAddAtoms)
           throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readEnergy

  private void readEnergy()
                   throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• setInfo

  private int setInfo​(java.lang.String info)
               throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readAtoms

  private void readAtoms​(int ac0,
                         boolean doAddAtoms)
                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• addBonds

  void addBonds​(java.lang.String data,
                int ac0)

• readBasis

  void readBasis()
          throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readMolecularOrbital

  void readMolecularOrbital()
                     throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readProperties

  void readProperties()
               throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readDipole

  void readDipole()
           throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• setDipole

  private void setDipole​(java.lang.String[] tokens)

• readProperty

  private void readProperty()
                     throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readVibFreqs

  void readVibFreqs()
             throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• setVibrationsFromProperties

  private void setVibrationsFromProperties()
                                    throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• getQuotedString

  private java.lang.String getQuotedString​(java.lang.String strQuote)

• parseInt

  private int parseInt​(java.lang.String info)

• parseFloat

  private float parseFloat​(java.lang.String info)

• readLine

  private java.lang.String readLine()
                             throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception